質譜儀重要的應用是別離同位素并測定它們的原子質量及相對豐度。測定原子質量的精度超越化學丈量辦法,大約2/3以上的原子的準確質量是用質譜辦法測定的。因為質量和能量的當量關系,由此可得到有關核結構與核結合能的常識。關于可通過礦石中提取的放射性衰變產物元素的剖析丈量,可斷定礦石的地質年代。質譜辦法還可用于有機化學剖析,特別是微量雜質剖析,丈量分子的分子量,為斷定化合物的分子式和分子結構供給牢靠的根據。因為化合物有著像指紋相同的質譜,質譜儀在工業生產中也得到廣泛應用。
當前,食物安全和農產品安全問題現已引起了多方關注,監管組織對食物農殘和其他污染物的監管力度逐步加大,檢測規范也趨于嚴厲。因為食物農產品的檢測對準確度和定量才能要求較高,具有高準確度的質譜儀便成為了大多數試驗室的檢測。
眾所周知,化合物的剖析比較復雜,尤其是一些高復雜性基體和小分子化合物,其化學結構的剖析更是困難重重。作為一種具有高化學結構解析度和高靈敏度的剖析辦法,質譜剖析在化合物剖析過程中尤為要害,質譜儀在相關研討范疇的效果愈加凸顯。